Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PATL2C9JE40 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms