Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms