Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms