Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSDA5PKW4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms