Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V9GY05 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V9GY05 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V9GY05 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms