Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNX8Q9Y5X2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms