Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHKBQ9Y259 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms