Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRPF3Q9ULD4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms