Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms