Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2LQ9UL33 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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