Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PACSIN3Q9UKS6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms