Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FBXL4Q9UKA2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms