Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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