Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms