Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL13Q9P2N7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms