Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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SH3BP4Q9P0V3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4Q9P0V3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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SH3BP4Q9P0V3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SH3BP4Q9P0V3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SH3BP4Q9P0V3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SH3BP4Q9P0V3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SH3BP4Q9P0V3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4Q9P0V3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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