Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms