Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDAP2Q9NXN4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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