Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A12Q9NXJ0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms