Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC18Q9NUE0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC18Q9NUE0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms