Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms