Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms