Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms