Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASS4Q9NQ75 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms