Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX9Q9NQ69 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms