Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms