Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP29Q9HBJ7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms