Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms