Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN1

ACTR6, Actin-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR6Q9GZN1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTR6Q9GZN1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTR6Q9GZN1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms