Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLHL4Q9C0H6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms