Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms