Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF17Q9BXT8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms