Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG6Q9BXT2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms