Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC94Q9BW85 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms