Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIRIP3Q9BW71 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms