Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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