Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGIP1Q9BQI5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGIP1Q9BQI5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms