Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAT1Q99536 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms