Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3AQ96ST3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms