Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms