Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CICQ96RK0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms