Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms