Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms