Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms