Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDC1Q96MU7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms