Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf72Q96LT7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf72Q96LT7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms