Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRIQ1Q96JM4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRIQ1Q96JM4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
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