Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms