Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CELF6Q96J87 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms