Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
LRRC39Q96DD0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms